De 14-jarige weesjongen Krabat wordt door een onheilspellende stem naar een geheimzinnige molen gelokt. Daar krijgt hij van de strenge meester een plek als leerling aangeboden. Al snel ontdekt Krabat dat hij, net als zijn 11 medeleerlingen, niet alleen onderwezen wordt in het handwerk rond de molen, maar dat ze ook lessen krijgen in zwarte magie. Eerst is Krabat enthousiast en gefascineerd, maar dan ontdekt hij hoe hoog de prijs is die de leerlingen moeten betalen...