Deze derde game in de PlayStation 2-serie van Naughty Dog zet de avonturen voort van de jonge held Jak en zijn bijna constante metgezel Daxter, een wijs krakend wezelachtig wezen. Terwijl Jak wordt blootgesteld aan de vluchtige substantie die bekend staat als "Light Eco", krijgt hij het vermogen om te veranderen in "Light Jak", een vorm die de "Dark Jak" -persoonlijkheid in balans brengt die hem zo goed van pas kwam in Jak II. Wanneer deze derde game begint, wordt Jak door een ironische wending gewantrouwd door de mensen van Haven, vanwege dezelfde Dark Eco-krachten die hem hadden geholpen om hun stad te redden in de vorige game. Samen met Daxter en hun nieuwe metgezel Pecker wordt Jak verbannen naar het uitgestrekte, gevaarlijke, mysterieuze eiland dat bekend staat als "Wasteland". Hier begint zijn derde avontuur in alle ernst. Wasteland is ontworpen om de grootste, meest gevarieerde wereld tot nu toe te zijn in een Jak-spel - vijf keer zo groot als Haven City - dus nogmaals, spelers willen misschien verschillende voertuigen zoeken die ze kunnen 'lenen' om van de ene plaats naar de andere te komen. plaats. De game draait op een vernieuwde engine die nu "lappenpop" -fysica bevat.