De belangrijkste thema's in 'Harry Potter en de Geheime Kamer' zijn vriendschap, moed en de strijd tussen goed en kwaad. Harry en zijn vrienden moeten niet alleen de mysterieuze aanvallen op leerlingen van Zweinstein onderzoeken, maar ook hun eigen angsten onder ogen zien. De boek behandelt ook hoe vooroordelen en schadelijke overtuigingen, zoals die over bloedlijn en afkomst, gevaarlijk kunnen zijn.
In 'De Geheime Kamer' zien we een groei in de relatie tussen Harry, Ron en Hermelien. Ze staan samen voor moeilijke situaties en steunen elkaar door dik en dun. De gebeurtenissen in het verhaal dwingen hen om elkaar meer te vertrouwen en samen te werken, wat hun band versterkt en hen nog hechter maakt als vrienden.
In dit boek worden verschillende nieuwe personages geïntroduceerd, zoals Dobby, de huiself die de vijandige bedoelingen van de Geheime Kamer onthult. We ontmoeten ook Gilderoy Lockhart, de zelfzuchtige en flamboyante leraar Verdediging Tegen de Zwarte Kunsten, die de jongens op zijn eigen manier beïnvloedt en de gang van zaken op Zweinstein verandert.
De Geheime Kamer heeft een rijke geschiedenis binnen Zweinstein, omdat het ooit door de oprichter Salazar Slytherin werd gemaakt. Het symboliseert de verdeeldheid tussen de verschillende huizen op school en belicht de gevaren van vooroordelen en haat. De Kamer heeft een belangrijke rol gespeeld in de geschiedenis van de school en de gevechten die daar plaatsvonden.
De gebeurtenissen in de Geheime Kamer stellen Harry voor een cruciale keuze tussen kwaad en goed en beïnvloeden zijn ontwikkeling als jong tovenaar. De ervaringen die hij daar opdoet, zoals het omgaan met angst en de gevolgen van vooroordelen, helpen hem om sterker en wijzer te worden in de volgende delen van de serie.